Les acides aminés sont les éléments constitutifs distincts des protéines. Parfois, le pédiatre peut décider de recommander une poudre  à base d’acides aminés libres. Par exemple, lorsqu'un enfant continue d’avoir des symptômes lors de l'utilisation d'un hydrolysat poussé de protéines (coupé). Les formules à base d'acides aminés sont fabriquées dans un environnement totalement exempt de protéines de lait de vache. Nutricia propose des denrées alimentaires destinées à des fins médicales spéciales entièrement sans lait de vache. Le système immunitaire ne reconnaît pas un acide aminé comme protéine de lait de vache.